Волохонский родился в 1936 году в Ленинграде. Там же окончил химико-фармацевтический институт, аспирантуру Института озерного рыбного хозяйства.
В течение более чем двух десятков лет работал в различных областях химии и экологии, автор научных трудов в этой области. В конце 1950-х Волохонский начал писать стихи, песни и пьесы, публиковался в самиздате.
В 1973 году поэт получил разрешение на выезд в Израиль, в середине 80-х уехал жить в Германию.
Волохонский написал большое количество поэтических произведений, от иронических миниатюр до поэм, в которых эпические и мифологические мотивы подвергаются неожиданной обработке, сочетающей иронию с метафизикой.
Наибольшую популярность Анри Волохонскому принесло стихотворение «Рай» («Над небом голубым…», «Город золотой»), написанное на музыку Владимира Вавилова. Композицию сперва исполнил Алексей Хвостенко, а затем Борис Гребенщиков в фильме «Асса».
